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種々の生態系における環境負荷因子汚染物質等の動態

赤松　美紀

  • 京都大学農学博士 准教授
  • 京都大学大学院農学研究科
  • 地域環境科学専攻 比較農業論講座
  • 〒606-8502　京都市左京区北白川追分町
  • 電話&FAX：075-753-6489
  • e-mail：akamatsu [atmark] kais.kyoto-u.ac.jp
  • オフィス：農学部総合館南棟 5階 S568室
  • 2012年農薬のコメンテーターとして、岡山放送の番組の電話によるインタビューを受けました！！！ 農薬の正しい使い方について説明しています。以下の日時、場所で放送されました。
    ３月１５日（木）岡山放送「温タイム」　１４：０５〜１４：２５
  • 2010年農薬のコメンテーターとして、15分テレビ番組に一部出演しました！！！ 家庭菜園における農薬の使い方について説明する番組です。以下の日時、場所で放送されました。2011年に再放送もされています。
    ８月２７日（金）岡山放送　１４：４０〜１４：５５
    ８月３０日（月）岐阜放送（名古屋もカバー）１８：００〜１８：１５
    １０月９日（土）信越放送　１５：３０〜１５：４５
  • 2009年4月1日 農薬のコメンテーターとして、KBS京都放送「ぼじポジたまご!」に出演しました！！！ 家庭菜園における農薬の使い方について説明しています。（10分程度）
    HPにはアップできませんが、いずれも放送のDVDがありますので、興味のある人はご連絡下さい。

研究活動

専門分野

  • 農薬・医薬の構造活性相関
  • 農薬と環境

化学的な実験およびコンピューターモデリングの手法を用いて、化学物質のリスク評価の観点から、最近は特にADME（吸収・分布・代謝・排泄）に関する構造活性相関研究を中心に行っています。
「構造活性相関」について薬学部で講義（一部担当）を行いました。

研究テーマ

  • Fujikawa, M., Ano, R., Nakao, K., Shimizu, R., and Akamatsu, M.: Relationships between structure and high-throughput screening permeability of diverse drugs with artificial membranes: application to prediction of Caco-2 cell permeability. Bioorg. Med. Chem., 13, 4721-4732 (2005)
  • Wheelock, C.E., Nakagawa, Y., Harada, T., Oikawa, N., Akamatsu, M., Smagghe, G., Stefanou, D., Iatrou, K., and Swevers, L.: High-throughput screening of ecdyson agonists using a reporter gene assay followed by 3-D QSAR analysis of the molting hormonal activity. Bioorg. Med. Chem., 14, 1143-1159 (2006)
  • Akamatsu, M., Fujikawa, M., Ano, R., Nakao, K., and Shimizu, R.: Relationships between structure and high-throughput screening permeability of diverse drugs with artificial membranes: application to prediction of Caco-2 cell permeability. In QSAR & Molecular Modelling in Rational Design of Bioactive Molecules (Proceedings of the 15th EuroQSAR 2004 Symposium) (Eds. Aki, E. and Yalcin, I.), Baskent Klise ve Matbaacilik, Ankara, pp. 166-167 (2006)
  • Minakuchi, C., Suzuki, J., Toda, K., Akamatsu, M., and Nakagawa, Y.: Estimation of the hydrophobicity of 2,4-diphenyl-1,3-oxazoline analogs and QSAR analysis of their ovicidal activity against Tetranycus urticae. Bioorg. Med. Chem. Lett., 16, 4080-4084 (2006)
  • Tamura, H., Ishimoto, Y., Fujikawa, T., Aoyama, H., Yoshikawa, H., and Akamatsu, M.: Structural basis for androgen receptor agonists and antagonists: Interaction of SPEED 98-listed chemicals and related compounds with the androgen receptor based on an in vitro reporter gene assay and 3D-QSAR. Bioorg. Med. Chem., 14, 7160-7174 (2006)
  • Shimomura, M., Yokota, M., Ihara, M., Akamatsu, M., Sattelle, D.B., and Matsuda, K.: Role in the selectivity of neonicotinoids of insect-specific basic residues in loop D of the nicotinic acetylcholine receptor agonist binding site. Mol. Pharmacol., 70, 1255-1263 (2006)
  • 赤松美紀：Classical および三次元構造活性相関手法による薬物動態解析, 創薬動態, 日本薬物動態学会，pp. 315-319 (2006)
  • Fujikawa, M., Nakao, K., Shimizu, R., and Akamatsu, M.: QSAR study on permeability of hydrophobic compounds with artificial membranes. Bioorg. Med. Chem., 15, 3756-3767 (2007)
  • Tomita, K., Oishi, S., Cluzeau, J., Ohno, H., Navenot, J.-M., Wang, Z., Peiper, S.C., Akamatsu, M., and Fujii, N.: SAR and QSAR studies on the N-terminally acylated pentapeptide agonists for GPR54. J. Med. Chem., 50, 3222-3228 (2007)
  • Tamura, H., Hosoda, A., and Akamatsu, M.: Endocrine disruptors that disrupt the transcription mediated by androgen receptor. J. Pestic. Sci., 33, 33-39 (2008)
  • 赤松美紀，藤川真章，中尾和也，清水　良：環境中に存在する化学物質のヒト経口吸収性を予測する，化学と生物, 46, 194-199 (2008)
  • Ihara, M., Okajima, T., Yamashita, A., Oda, T., Hirata, K., Nishiwaki, H., Morimoto, T., Akamatsu, M., Ashikawa, Y., Kuroda, S., Mega, R., Kuramitsu, S., Sattelle, D. B., and Matsuda, K.: Crystal structures of Lymnaea stagnalis AChBP in complex with neonicotinoid insecticides imidacloprid and clothianidin. Invert. Neurosci., in press (2008)
  • 赤松美紀：タイの農薬事情(2)―バンコク近郊農業地帯における環境中の残留農薬―，日本農薬学会誌, 33, 204-208 (2008)
  • Toshima, K., Kanaoka, S., Yamada, A., Tarumoto, K., Akamatsu, M., Sattelle, D.B., and Matsuda, K.: F Combined roles of loops C and D in the interactions of a neonicotinoid insecticide imidacloprid with the α4β2 nicotinic acetylcholine receptor. Neuropharmacol. 56, 264-272 (2009)
  • Fujikawa, M., Nakao, K., Shimizu, R., and Akamatsu, M.: The usefulness of an artificial membrane accumulation index for estimation of the bioconcentration factor of organophosphorus pesticides. Chemosphere, 74, 751-757 (2009)
  • Nakao, K., Fujikawa, M., Shimizu, R., and Akamatsu, M.: QSAR application for the prediction of compound permeability with in silico descriptors in practical use. J. Comput. Aided Mol Des., 23, 309-319 (2009)
  • Matsuda, K., Kanaoka, S., Akamatsu, M., and Sattelle，D. B.: Diverse actions and target-site selectivity of neonicotinoids: structural insights. Mol. Pharmacol., 76, 1-10 (2009)

 

http://molpharm.aspetjournals.org/cgi/issue_pdf/frontmatter_pdf/76/1
本論文の図が雑誌の表紙を飾りました！

 

  • Akamatsu, M., Fujikawa, M., Nakao, K., and Shimizu, R.: In silico prediction of human oral absorption based on QSAR analyses of PAMPA permeability. Chemistry and Biodiversity, 6, 1845-1866 (2009)
  • Sattelle，D. B., Buckingham, S. D., Akamatsu, M., Matsuda, K., Pienaar, I., Jones, A. K., Sattelle, B. M., Almond, A., and Blundell, C. D.: Comparative pharmacology and computational modelling yield insights into allosteric modulation of human α7 nicotinic acetylcholine receptors. Biochem. Pharmacol., 78, 836-843 (2009)
  • Ogawa, Y., Akamatsu, M., Hotta, Y., Hosoda, A., Tamura, H.: Effect of essential oils, such as raspberry ketone and its derivatives, on antiandrogenic activity based on in vitro reporter gene assay. Bioorg. Med. Chem. Lett., 20, 2111-2114 (2010)
  • Akamatsu, M.: Importance of physicochemical properties for design of new pesticides. J. Agric. Food Chem., 59, 2909-2917 (2011)
  • Nishiwaki, H., Hasebe, A., Kawaguchi, Y., Akamatsu, M., Shuto. Y., Yamauchi. S.: Larvicidal activity of (-)-dihydroguaiaretic acid derivatives against Culex pipiens. Biosci. Biotechnol. Biochem., 75, 1735-1739 (2011)
  • Nishiwaki, H., Kuriyama, M., Nagaoka, H., Kato, A., Akamatsu, M., Yamauchi, S., Shuto. Y.: Synthesis of imidacloprid derivatives with a chiral alkylated imidazolidine ring and evaluation of their insecticidal activity and affinity to　the nicotinic acetylcholine receptor. Bioorg. Med. Chem., 20, 6305-6312 (2012)
  • Akamatsu, M., Tsujita, K., Pitiyont, V., Saejiew, A., Jiwajinda, S., Tanaka, U: Pesticide residue analyses of soils collected from suburban agricultural fields around Bangkok. Trop. Agr. Develop., 57, 8-15 (2013)
  • Kanaoka, S., Kimura, Y., Fujikawa, M., Nakagawa, Y., Ueda, K., Akamatsu, M.: Substrate recognition by P-glycoprotein efflux transporters: Structure-ATPase activity relationship of diverse chemicals and agrochemicals. J. Pestic. Sci., 38, 112–122 (2013)
  • 赤松美紀：QSARパラメーターとその応用，日本農薬学会誌, 38, 195-203　(2013)
  • Ihara,　M., Shimazu, N., Utsunomiya, M., Akamatsu, M., Sattelle, D. B., Matsuda, K.: A single amino acid polymorphism in the wild-type Drosophila melanogaster Dα1 (ALS) subunit strikingly influences agonist efficacy of imidacloprid for Dα1-chicken β2 hybrid nicotinic acetylcholine receptor expressed in Xenopus laevis oocytes. Biosci. Biotech. Biochem., 78, 543-549 (2014), DOI: 10.1080/09168451.2014.891928.
  • Morishita, C., Minakuchi, C., Yokoi, T., Takimoto, S., Hosoda, A., Akamatsu, M. , Tamura, H., Nakagawa, Y.: cDNA cloning of ecdysone receptor (EcR) and ultraspiracle (USP) from Harmonia axyridis and Epilachna vigintioctopunctata and the evaluation of the binding affinity of ecdysone agonists to the in vitro translated EcR/USP　heterodimers．J. Pestic. Sci., 39, 76-84 (2014)
  • Furutani, S., Ihara, M., Nishino, Y., Akamatsu, M., Jones, A. K., Sattelle, D. B., Matsuda, K.: Exon 3 splicing and mutagenesis identify residues influencing cell surface density of heterologously-expressed silkworm (Bombyx mori) glutamate-gated chloride channels. Mol. Pharmacol., 86, 1-11 (2014), DOI: 10.1124/mol.114.095869
  • Ho Le Quynh Chau, Ho Trung Thong, Nguyen Van Chao, Pham Hoang Son Hung, Vu Van Hai, Le Van An, Fujieda, A., Tanaka, U., Akamatsu, M.: Microbial and Parasitic Contamination on Fresh Vegetables Sold in Traditional Markets in Hue City, Vietnam. J. Food Nut. Res., 2, 959-964 (2014), DOI: 10.12691/jfnr-2-12-16
  • Nagaoka, H., Nishiwaki. H., Kubo, T., Akamatsu, M., Yamauchi, S., Shuto, Y.: Docking model of the nicotinic acetylcholine receptor and nitromethylene neonicotinoid derivatives with a longer chiral substituent and their biological activities. Bioorg. Med. Chem., 23, 759-769 (2015)
  • Shirotani, N., Togawa, M., Ikushiro, S., Sakaki, T., Harada, T., Miyagawa, H., Matsui, M., Nagahori, H., Mikata, K., Nishioka, K., Hirai, N., Akamatsu, M.: Identification and in Silico prediction of metabolites of the model compound, tebufenozide by human CYP3A4 and CYP2C19. Bioorg. Med. Chem., 23, 6594-6601 (2015), DOI:10.1016/j.bmc.2015.09.019
  • Maeshibu, N., Han, B., Ma, J., Miyahara, K., Torii,, K., Ho Tan Duc, Tran Thi Thu Ha, Le Van An, Ho Trung Thong, Akamatsu, M.: Pesticide use and residue in the environment in Hue, Vietnam. Proceeding of the 36th Asian Conference of Remote Sensing, Manila, Phillipines, 2015
  • Miyata, K., Nakagawa, Y., Kimura, Y., Ueda, K., Akamatsu, M.: In vitro and in vivo evaluations of the P-glycoprotein-mediated efflux of dibenzoylhydrazines. Toxicol. Appl. Pharmacol., 298, 40-47 (2016), doi:10.1016/j.taap.2016.03.008
  • Miyata, K., Nakagawa, Y., Kimura, Y., Ueda, K., Akamatsu, M.: Structure–activity relationships of dibenzoylhydrazines for the inhibition of P-glycoprotein-mediated quinidine transport. Bioorg. Med. Chem., 24, 3184-3191 (2016), doi:10.1016/j.bmc.2016.05.039.

国内における学会活動など

  • 所属学会等
  • 日本農芸化学会
  • 日本農薬学会
  • 日本薬学会
  • 日本ペプチド学会

国際交流・海外活動

  • 国際学会・研究集会等（役割）
  • ベトナムにおける残留農薬の環境への影響評価(2015年継続）（ベトナム）
  • 第10回薬物の分子設計と開発に関する日中合同シンポジウム(2015年）、日本、徳島(発表）
  • 第20回ヨーロッパ定量的構造活性相関シンポジウム(2014年）、サントペテルブルグ、ロシア（発表）
  • 第9回薬物の分子設計と開発に関する日中合同シンポジウム(2012年）、中国、桂林(日本側実行委員長、発表）
  • 第18回ヨーロッパ定量的構造活性相関シンポジウム(2010年）、ロドス島、ギリシャ（プログラムアドバイザー、発表）
  • アメリカ化学会2010年春国際会議、サンフランシスコ、アメリカ合衆国（招待講演）

教育活動

担当授業科目

  • 比較資源環境学／農学研究科・後期
  • 日本の農業と環境／農学研究科・留学生向け・前期
  • その他
  • 農林水産省「農薬分科会」委員
  • 環境省「土壌農薬部会」臨時委員
  • 日本薬学会構造活性相関部会常任幹事
  • [学部内委員］国際交流委員会委員

 

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